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| 本文作者： 任平 | 2023-10-24 17:45 |
2023年11月5日起，“系統(tǒng)生物學(xué)系列講座”將從開始第一講，后續(xù)每兩周進(jìn)行一期，將涉及系統(tǒng)生物學(xué)的基礎(chǔ)理論、常用方法、以及在生物醫(yī)學(xué)問題中的具體應(yīng)用研究。
該系列講座由中國生物信息學(xué)學(xué)會（籌）系統(tǒng)生物學(xué)專業(yè)委員會主辦，通過B站進(jìn)行在線直播。
雷峰網(wǎng)(公眾號：雷峰網(wǎng))《醫(yī)健AI掘金志》作為大會首席合作媒體，將全程參與報(bào)道。
系統(tǒng)生物專委會，于2023年8月25日正式成立，擁有專委會委員60余名。專業(yè)委員會的成立，旨在凝聚國內(nèi)力量，培養(yǎng)人才團(tuán)隊(duì)，推動(dòng)學(xué)科發(fā)展，擴(kuò)大學(xué)科影響。
一方面，促進(jìn)系統(tǒng)生物學(xué)理論基礎(chǔ)、技術(shù)框架的交流構(gòu)建，揭示疾病演化的驅(qū)動(dòng)力及規(guī)律；
另一方面，推動(dòng)基于系統(tǒng)生物學(xué)的新技術(shù)新產(chǎn)品研發(fā)，解決生命醫(yī)學(xué)研究碎片化、重大產(chǎn)品和系統(tǒng)缺失等重點(diǎn)難點(diǎn)問題，最終更好地服務(wù)于滿足人民健康需求、推動(dòng)新型醫(yī)學(xué)發(fā)展、服務(wù)于國民社會經(jīng)濟(jì)的國家戰(zhàn)略。
迄今為止，系統(tǒng)生物學(xué)專業(yè)委員會已采取3種形式的學(xué)術(shù)交流活動(dòng)：
1. 從2023年起，定期舉辦“系統(tǒng)生物學(xué)” 線上講座；
2. 設(shè)立“系統(tǒng)生物學(xué)”暑期課程；
3. 在現(xiàn)有“腫瘤系統(tǒng)生物學(xué)國際研討會” 【ICSB年度會議】的基礎(chǔ)上，舉辦“系統(tǒng)生物學(xué)全國學(xué)術(shù)大會”。
今年8月26日-27日，由系統(tǒng)生物學(xué)專委會聯(lián)合主辦的“第十二屆腫瘤系統(tǒng)生物學(xué)國際研討會”已順利召開，由系統(tǒng)生物學(xué)專委會主任、南科大醫(yī)學(xué)院講席教授徐鷹任大會主席，20位國內(nèi)外專家進(jìn)行了精彩報(bào)告。該會議共吸引了三百余人在現(xiàn)場參會，一萬九千多人在網(wǎng)上參加。
系統(tǒng)生物學(xué)系列講座目前已經(jīng)確定的特邀報(bào)告人依次（按照講座日期順序）為：
南方科技大學(xué)徐鷹教授（11月5日）
蘇州大學(xué)時(shí)玉舫教授（歐洲科學(xué)院院士）（11月19日）
Nature Methods資深編輯Arunima Singh博士（12月3日）
紐約州立大學(xué)石溪分校汪勁教授（12月17日）
中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院陳洛南研究員（1月21日）
北京大學(xué)韓敬東教授（2月4日）
中國科學(xué)院數(shù)學(xué)與系統(tǒng)科學(xué)研究院李雷研究員（2月18日）
西安交通大學(xué)于軍教授（兼任GPB 主編）（3月3日）
Nature Communications副編輯程謙博士（3月17日）
北京大學(xué)來魯華教授（3月31日）
除程謙博士講座于當(dāng)天北京時(shí)間晚8點(diǎn)-9點(diǎn)半進(jìn)行外，其余均于上午9點(diǎn)-10點(diǎn)半進(jìn)行。包含50分鐘報(bào)告時(shí)間，40分鐘討論時(shí)間。
B站直播二維碼如下，歡迎大家掃碼并積極極參與。
徐鷹 ，南方科技大學(xué)醫(yī)學(xué)院講習(xí)教授
徐鷹 ，南方科技大學(xué)醫(yī)學(xué)院講習(xí)教授，獲國家級人才頭銜，計(jì)算系統(tǒng)生物學(xué)及生物信息學(xué)者。研究方向?yàn)槟[瘤系統(tǒng)生物學(xué)。
2023年1月加入南方科技大學(xué)醫(yī)學(xué)院，之前為美國佐治亞大學(xué)生物化學(xué)系“校董事會教授”及“佐治亞科學(xué)協(xié)會著名學(xué)者講席教授”(2003-2022)，佐治亞大學(xué)生物信息研究所首任所長(2003-2011)。
他是AAAS Fellow及IEEE Fellow。1991年獲得美國科羅拉多大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)博士學(xué)位（組合數(shù)學(xué)和算法）。1993年加入美國橡樹嶺國家實(shí)驗(yàn)室，工作十年，歷任助理研究員、研究員、資深研究員及課題組長（senior staff scientist and group leader）。2003年，他的研究團(tuán)隊(duì)加盟佐治亞大學(xué)，成立生物信息研究所，同時(shí)入職佐治亞大學(xué)生化系。自2008年起，開始通過腫瘤組學(xué)數(shù)據(jù)研究腫瘤發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移的推手和機(jī)理。
目前徐鷹共發(fā)表近400篇學(xué)術(shù)論文，五部著作，包括世界上第一部“腫瘤信息學(xué)”專著，引文 19500余次、H指數(shù)為70。自2003年起，每年在國內(nèi)主持召開“生物信息學(xué)國際研討會(2003-2013)，及“腫瘤系統(tǒng)生物學(xué)國際研討會”(2011年起)，并每年主講“生物信息學(xué)”或“腫瘤信息學(xué)”暑期課程，共吸引3萬余人參加。
時(shí)玉舫，蘇州大學(xué)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究院院長
時(shí)玉舫，蘇州大學(xué)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究院院長，長期從事免疫與干細(xì)胞研究。
1982年本科畢業(yè)于山東農(nóng)學(xué)院（現(xiàn)為山東農(nóng)業(yè)大學(xué)），1982年至1985年在山東農(nóng)學(xué)院畜牧獸醫(yī)系擔(dān)任助教，1988年和1992年在加拿大阿爾伯塔大學(xué)獲碩士和博士學(xué)位，1992年至1995年在加拿大多倫多大學(xué)從事博士后研究。1995年至2001年任教于美國喬治?華盛頓大學(xué)微生物與免疫學(xué)系和美國紅十字會赫蘭生物醫(yī)學(xué)研究所免疫學(xué)系。2001年至2008年，在美國新澤西醫(yī)科齒科大學(xué)羅伯特?強(qiáng)生醫(yī)學(xué)院分子遺傳、微生物和免疫學(xué)系任終身教授和特聘大學(xué)教授。2008年至2014年，任中國科學(xué)院上海生命科學(xué)院/上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院健康科學(xué)研究所所長、研究員。現(xiàn)任蘇州大學(xué)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究院院長。
他長期從事免疫與干細(xì)胞研究，在探索免疫穩(wěn)態(tài)維持和組織再生修復(fù)的細(xì)胞與分子機(jī)制等方面取得了一系列原創(chuàng)性、突破性和引領(lǐng)性成果。迄今為止，世界上對干細(xì)胞與免疫反應(yīng)相互調(diào)控的認(rèn)知大多源于時(shí)玉舫及其團(tuán)隊(duì)的科學(xué)發(fā)現(xiàn)。
Arunima Singh，Nature Methods資深編輯
現(xiàn)任Nature Methods資深編輯。計(jì)算結(jié)構(gòu)生物學(xué)家，研究領(lǐng)域包括分子建模，蛋白質(zhì)-碳水化合物和蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。古吉拉特大學(xué)生物化學(xué)理學(xué)學(xué)士、浦那大學(xué)生物信息學(xué)碩士、佐治亞大學(xué)生物信息學(xué)博士。
汪勁，紐約州立大學(xué)石溪分校教授
汪勁，現(xiàn)任紐約州立大學(xué)石溪分校化學(xué)和物理及天文系教授，主要從事專業(yè)為生物物理、計(jì)算生物物理、結(jié)構(gòu)生物學(xué)等研究，建立了勢和流的景觀理論并廣泛應(yīng)用于各類生物及復(fù)雜系統(tǒng)。提出了量化特異性的概念和方法并應(yīng)用于藥物設(shè)計(jì)。
1984年本科畢業(yè)于吉林大學(xué)物理系，1991年博士畢業(yè)于伊利諾斯大學(xué)天體物理學(xué)，1996年在伊利諾斯大學(xué)完成化學(xué)和生物物理博士后訓(xùn)練，2000年獲得美國紐約大學(xué)石溪分校工商管理碩士。
曾任花旗銀行全球戰(zhàn)略分析部資深分析師及副總裁。歐洲科學(xué)院院士，美國科學(xué)促進(jìn)學(xué)會會士，美國物理學(xué)會會士。
陳洛南，中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院研究員
陳洛南，中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院研究員，長期采用系統(tǒng)工程、動(dòng)力學(xué)建模等方式研究復(fù)雜疾病的發(fā)生機(jī)制。
1984年本科畢業(yè)于華中科技大學(xué)電氣工程專業(yè)，1988年和1991年分別獲日本東北大學(xué)系統(tǒng)科學(xué)碩士、博士學(xué)位。1997年起在日本大阪產(chǎn)業(yè)大學(xué)電氣工程和電子學(xué)院任教，在日本和美國從事科研教學(xué)工作等25年以上，2009年10月加入中科院上海生命科學(xué)研究院。
近年來，在系統(tǒng)生物學(xué)和復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)等研究領(lǐng)域發(fā)表了350余篇期刊論文及10余部編著書籍，論文總引用超2萬次。并擔(dān)任中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)會分子系統(tǒng)生物學(xué)專業(yè)分會主任委員，IEEE-SMC系統(tǒng)生物學(xué)委員會主席，中國運(yùn)籌學(xué)會計(jì)算系統(tǒng)生物學(xué)分會名譽(yù)理事長，中國藥理學(xué)會網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)專業(yè)委員會副主任委員等。
韓敬東，北京大學(xué)教授
韓敬東，北京大學(xué)定量生物學(xué)中心研究員、北京大學(xué)-清華大學(xué)生命科學(xué)聯(lián)合中心研究員，現(xiàn)任計(jì)算生物學(xué)所所長。
1991年獲中國藥科大學(xué)學(xué)士，1996年獲Albert Einstein College of Medicine 博士、1997－1998年，The Rockefeller University 博士后，1999－2002年進(jìn)入業(yè)界擔(dān)任IT軟件工程師，2002－2004年為Dana Farber Cancer Institute and Harvard Medical School博士后。
研究領(lǐng)域包括發(fā)育與衰老的系統(tǒng)生物學(xué)、調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的計(jì)算推理、圖像分析，數(shù)據(jù)集成和網(wǎng)絡(luò)分析的計(jì)算算法開發(fā)。
李雷，中國科學(xué)院數(shù)學(xué)與系統(tǒng)科學(xué)研究院研究員
李雷，中國科學(xué)院數(shù)學(xué)與系統(tǒng)科學(xué)研究院關(guān)肇直首席研究員。研究方向包括計(jì)算生物學(xué)與基因組學(xué)、長壽與衰老機(jī)制、統(tǒng)計(jì)建模與統(tǒng)計(jì)計(jì)算、時(shí)間序列分析、和信息論。
于北京大學(xué)獲得學(xué)士和碩士學(xué)位，1998年于美國加州大學(xué)伯克利分校統(tǒng)計(jì)系獲博士學(xué)位。2000年9月- 2002年12月加利福尼亞大學(xué)洛杉磯分校，純粹與應(yīng)用數(shù)學(xué)研究所，博士后。2002-2010 年在南加利福尼亞大學(xué)計(jì)算生物及數(shù)學(xué)系任教并于2005年獲得終身職務(wù)。
李雷博士與國際著名統(tǒng)計(jì)學(xué)家、澳大利亞科學(xué)院院士 Terence P. Speed教授，計(jì)算生物學(xué)的先驅(qū)、美國科學(xué)院院士Michael Waterman教授，老齡研究專家Valter Longo教授等長期合作并取得重要成果。李雷博士與Speed教授發(fā)展的DNA測光度校正方法已成為新一代Illumina/Solexa快速測序儀的工業(yè)標(biāo)準(zhǔn)。2010年入選中國科學(xué)院“百人計(jì)劃（國外杰出人才）”。
于軍，西安交通大學(xué)教授
于軍，西安交通大學(xué)國家生物安全證據(jù)基地、北京基因組研究所（國家生物信息中心）榮譽(yù)教授，兼任GPB（Genomics, Proteomics & Bioinformatics，基因組蛋白質(zhì)組與生物信息學(xué)報(bào)）主編。
研究領(lǐng)域包括基因組學(xué)、生物信息學(xué)、生物醫(yī)學(xué)儀器。
1983年畢業(yè)于吉林大學(xué)生化專業(yè)，同年考入中科院生物物理所讀研，并考取CUSBEA獎(jiǎng)學(xué)金，于1984年赴美國紐約大學(xué)醫(yī)學(xué)院攻讀生物醫(yī)學(xué)博士。1990年獲得博士學(xué)位后在NYU任研究助理教授，1993年加盟華盛頓大學(xué)（西雅圖）基因組科學(xué)系，參與國際人類基因組計(jì)劃，從事基因組學(xué)和生物信息學(xué)研究，同時(shí)開發(fā)相關(guān)科學(xué)實(shí)驗(yàn)設(shè)備與儀器。
于軍博士1998年歸國后先后參與組建了“華大基因”，中科院北京基因組研究所（包括國家生物信息中心和國家基因組數(shù)據(jù)中心），參與并主持了國際人類基因組計(jì)劃（中國部分），以及超級雜交水稻、家蠶、雞、椰棗、人參、鯉魚等大型基因組研究計(jì)劃，兩次擔(dān)任國家973計(jì)劃的首席科學(xué)家。
程謙，Nature Communications副編輯
先后畢業(yè)于英國牛津大學(xué)、劍橋大學(xué)，英國牛津大學(xué)Weatherall分子醫(yī)學(xué)研究所計(jì)算生物學(xué)中心博士后研究員，合作導(dǎo)師為Edward Morrissey博士，研究方向是通過開發(fā)和應(yīng)用數(shù)學(xué)與統(tǒng)計(jì)模型研究組織內(nèi)的干細(xì)胞命運(yùn)。2022年9月起擔(dān)任Nature Communications副編輯。
來魯華，北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院長江特聘教授
來魯華，北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院長江特聘教授、副院長、物理化學(xué)研究所所長，北京大學(xué)定量生物學(xué)中心副主任，北京大學(xué)-清華大學(xué)生命科學(xué)聯(lián)合中心成員。
研究領(lǐng)域?yàn)榛瘜W(xué)與生物學(xué)的交叉研究，主要方向是采用理論計(jì)算與實(shí)驗(yàn)密切結(jié)合的方法定量研究生物分子作用機(jī)制并進(jìn)行蛋白質(zhì)、藥物和生物系統(tǒng)設(shè)計(jì)。
1984年至1989年，先后在北京大學(xué)化學(xué)系完成本碩博學(xué)習(xí)，1998-1999年，美國加州大學(xué)伯克萊分校化學(xué)系伯克萊學(xué)者。1992年至今擔(dān)任北京大學(xué)化學(xué)學(xué)院教授，2001年被評為北京大學(xué)化學(xué)學(xué)院長江特聘教授。
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